Die Kooperation wird durch die Anbindung an das Selma Stern Zentrum für Jüdische Studien Berlin-Brandenburg intensiviert und institutionalisiert. Mit der Kooperation sollen gemeinsame Austauschprogramme, Forschungsprojekte und Konferenzen sowie der Austausch von Forschungsmaterialien erleichtert werden.
Das Selma Stern Zentrum ist ein überregionaler, interinstitutioneller Verbund der drei großen Berliner Universitäten (Freie Universität Berlin, Humboldt-Universität zu Berlin, Technische Universität Berlin), der Europa-Universität Viadrina Frankfurt (Oder), der Universität Potsdam, des Abraham Geiger Kollegs und des Moses Mendelssohn Zentrums für europäisch-jüdische Studien. Die Hochschule für Musik Franz Liszt Weimar ist kooptiertes Mitglied. Seit seiner Gründung hat sich das Selma Stern Zentrum zu einem international beachteten Forschungszentrum und -netzwerk entwickelt. Die Struktur des Zentrums verbindet die sieben wichtigsten Akteure der wissenschaftlichen Untersuchung des Judentums in seinen religiösen wie kulturellen Ausprägungen der Wissenschaftsregion Berlin-Brandenburg.
Im Rahmen der Strategischen Partnerschaft, die seit 2011 die Freie Universität Berlin und die Hebräische Universität Jerusalem miteinander verbindet, ist ein Kooperationsvertrag ausgearbeitet worden, der das Selma Stern Zentrum und die Hebrew University of Jerusalem im Bereich der Jüdischen Studien in strategischer Absicht vernetzen soll. Die Anbindung an das Selma Stern Zentrum stellt sicher, dass die gesamte Wissenschaftsregion Berlin-Brandenburg von dieser Kooperation profitiert. Die Unterzeichnung fand am 9. Dezember im Rahmen eines Festakts statt.