Bioökonomie International 2016: ENDOBICA – Neue antimikrobielle Verbindungen und endophytische Bakterien für die Entwicklung verbesserter biologischer Pflanzenschutzmittel

Das Gesamtziel des beantragten Vorhabens ist die Charakterisierung neuer endophytischer Bakterien aus pflanzlichem Gewebe und der Rhizosphäre sowie die Erforschung der von ihnen gebildeten antimikrobiellen Wirkstoffe zur Entwicklung verbesserter biologischer Pflanzenschutzmittel und zur Ertragsteigerung von Nutzpflanzen. Solche Endophyten mit antagonistischer Wirkung gegen Pflanzenpathogene werden von den vietnamesischen Partnern isoliert und den deutschen Partnern (IMAB/RKI) zur detaillierten Erforschung bereitgestellt. In diesem Rahmen führt das RKI umfangreiche Arbeiten zur hochauflösenden taxonomischen Charakterisierung dieser Mikroorganismen durch. Einen weiteren Schwerpunkt bildet die Erforschung der biosynthetischen Kapazität der Endophyten-Isolate. Hierbei werden die gebildeten bioaktiven Naturstoffe massenspektrometrisch identifiziert und ihre Struktur mit Hilfe moderner, massenspektrometrischer Techniken aufgeklärt. Die Ergebnisse dieser Untersuchungen werden mit Genome Mining-Analysen des IMAB zusammengeführt und auf diese Weise die Biosynthese der isolierten Verbindungen im Detail erforscht. Dieses Know-how bildet die Basis für zielgerichtete Mutationen mit der CRISPR/Cas9-Technik und zur Entwicklung von Hochleistungsstämmen, die die Reduktion des Einsatzes chemischer Pestizide in der Landwirtschaft durch eine umweltverträgliche Methode ermöglichen.