ERASysAPP1 - Verbundprojekt: SysMetEx - Systembiologie acidophiler Biofilme für die effiziente Metallgewinnung - Deutsches Teilprojekt B

In diesem Projekt soll die Biofilmbildung auf Chalcopyrit-Oberflächen für die wichtigsten, moderat thermophilen biolaugenden Bakterien, Acidithiobacillus caldus, Leptospirillum ferriphilum and Sulfobacillus thermosulfidooxidans mit Methoden der Mikroskopie und Proteomik untersucht werden. Dies ist ein internationales Projekt, bei dem die beteiligten deutschen Partner, Universität Duisburg-Essen (UDE) und Ruhr-Universität Bochum (RUB), die erhaltenen Daten für die weitere bioinformatische Auswertung und Modellierung an internationale Partner weitergeben. Da besonderes Merkmale des Versuchsaufbaus die genau definierte mikrobielle Zusammensetzung und bekannte Kultivierungsbedingungen sind, ermöglicht dieses Projekt die Etablierung und Überprüfung neuer Ansätze zum Messen und Modellieren der Biofilmbildung von bakteriellen Mischpopulationen. Im Detail werden UDE und RUB folgende Arbeiten durchführen:1. Integrative Analyse der zeitlichen und örtlichen Biofilmbildung mit Mikroskopie und Proteomik auf der Ebene einzelner Spezies und molekularer Netzwerke2. Bereitstellung großer Datensätze für ausführliche bioinformatische Analysen und die Aufstellung von Multi-Spezies Modellen (basierend auf Bilddaten von UDE) und biologischen Netzwerkwerkmodellen (basierend auf Proteomdaten von RUB), welche von den internationalen Partner durchgeführt werden.