Maschinelles Lernen für das Engineering und die Expression von pflanzlichen Chitinasen - Wissenschaftleraustausch

Im Projekt MERLIN wird angestrebt die erfolgreiche Zusammenarbeit zwischen der Rheinisch-Westfälischen Technischen Hochschule Aachen (RWTH) und dem Federal Research Centre "Fundamentals of Biotechnology" of the Russian Academy of Sciences (FRC) durch den Aufbau eines neuen gemeinsamen Arbeitsgebietes zu vertiefen. Hierzu werden wieder die komplementären Expertisen im Bereich Protein Engineering/Pflanzenschutz (RWTH) und Stammentwicklung/Produktion (FRC) kombiniert, um die Grundlagen für die Nutzung maßgeschneiderter Chitinasen als nachhaltige Pflanzenschutzmittel zu legen. Der FRC-Partner wählt mit seiner Erfahrung die Chitinasen aus, optimiert letztere für die Expression in seinen Produktionsstämmen und führt erste Prozessentwicklungen in 1-L-Fermentern durch. Der RWTH Partner entwickelt und validiert im 96ziger Mikrotiterplattenformat ein Gelenktes Chitinase-Evolutionsprotoll, das im Folgeprojekt zur weiteren Eigenschaftsverbesserung genutzt werden soll. Ferner entwickelt der RWTH und validiert der RWTH Partner basierend auf BSLA- und Cellulase-Datensätzen (letztere aus gemeinsam (RWTH/FRC) BMBF Projekt EnzyBioDeg) um über einen Algorithmus für maschinelles Lernen, das das Protein Engineering von Chitinasen im Folgeprojekte durch die Kombination von rationalem und evolutivem Design effizient ermöglichen soll.