Verbundprojekt: Charakterisierung und Prädiktion allogener Immunantworten nach Stammzelltransplantation; Teilprojekt: Mehrschichtige Analyse von Genexpression und Variantendaten

Allogene hämatopoetischen Stammzelltransplantationen (alloHSCT) von Humanen Leukozytenantigen (HLA)-passenden Spendern können das Überleben von Patienten mit akuter myeloischer Leukämie (AML) signifikant verbessern. AlloHSCT ist eine Immuntherapie, bei der transplantat-abgeleitete T-Zellen Leukämiezellen abtöten (Transplantat-gegen-Leukämie-Effekt TvL). Das Verfahren birgt jedoch das Risiko einer lebensbedrohlichen Transplantat-gegen-Wirt-Reaktion (TgWR), bei der Spender-T-Zellen die gesunden Organe des Wirts angreifen. Das Risiko, an TgWR zu sterben, liegt nach dem Tod an der Primärerkrankung an zweiter Stelle. Es ist nicht bekannt, warum manche Patienten Nebenwirkungen haben und andere nicht. So ist die Vorab-Identifizierung von Patienten mit hohem Risiko für die Entwicklung einer TgWR ein wichtiges Ziel in der alloHSCT. Der molekulare Mechanismus von TvL und TgWR besteht im Erkennen HLA-gebundener Antigene durch T-Zellen. COMPAIR verwendet HLA-Peptidomics, um HLA-gebundene Peptide von Spendern und Empfängern zu identifizieren. Das wird kombiniert mit Daten zu genetischen Varianten zwischen Spendern und Empfängern und zur Genexpressionsanalyse von gesunden Organen und Leukämiezellen. Ziel von COMPAIR ist die Entwicklung eines personalisierten Tests für Patienten mit AML, um das Risiko für die Entwicklung einer TgWR zu ermitteln. Der Test prognostiziert vor der Transplantation die Reaktion eines Patienten, leitet immunsuppressive Therapien und evtl. die Auswahl eines alternativen Spenders ab. In dem Teilprojekt analysiert Alacris die molekularen Daten von Spender- und Empfängerpaaren bioinformatisch. Varianten- und Genexpressionsanalysen werden durchgeführt, um Kandidaten für die Differenzierung zwischen TgWR und TvL zu bestimmen, die einen Anti-Leukämie-Effekt ausüben. Diese vielschichtige Analyse von Genexpression- und Variantendaten bildet die Basis für die Entwicklung des auf HLA-Peptidomik basierenden diagnostischen Assays.