Verbundprojekt: Einzelzell-Drucker für die genomische und massenspektrometrische Analyse einzelner Bakterien; Teilprojekt: Entwicklung von Dispensier-Chips und Assays für die Einzelzellgenomik, und einer verbesserten Tropfenkristallisation für MALDI-TOF Analysen

Die Analyse einzelner lebender Zellen ist von herausragender Bedeutung für verschiedenste Bereiche der Lebenswissenschaften und der Medizin. Untersuchungen an heterogenen Zellpopulationen führen nur zu gemittelten Daten, so dass beispielsweise therapieentscheidende Informationen kleinerer Subpopulationen verloren gehen. In SiBaGEM werden von der Universität Freiburg neue Dispensierchips und Assays für den Einzelzelldrucker entwickelt, wodurch eine automatisierte Analyse einzelner Bakterienzellen auf Genom- und Transkriptomebene ermöglicht werden soll. Des Weiteren soll durch die gezielte experimentelle Untersuchung der für die Technologie maßgeblichen Tropfenentstehung neue Erkenntnisse geschaffen werden, für (i) die elektrostatische Neutralisation der Tropfen, (ii) die Tropfensortierung mit höherem Durchsatz, und (iii) die kontrollierte Kristallisierung einer MALDI Matrix für die nachfolgende Analyse einzelner Bakterien mit einem neuartigem Massenspektrometer. Das Ziel von SiBaGEM ist eine verbesserte Diagnostik von Infektionskrankheiten mit größer Informationstiefe, kostengünstiger, und in kürzerer Zeit bis hin zu einer Point-of Care-Anwendung.