Verbundprojekt: Monitoring des Behandlungserfolgs von Krebsimmuntherapien durch Analyse des Immunrepertoires; Teilprojekt: Erstellung einer Wissensmanagementplattform für die Systemmedizin im Bereich Krebsimmuntherapien

IMMUNOMONITOR entwickelt und validiert eine Software zum Monitoring des Behandlungserfolges von Krebsimmuntherapien durch die Analyse von Immunrepertoire Sequenzdaten. Dazu werden für Standard-Next-Generation-Sequencing-Protokolle Analysealgorithmen und Visualisierungswerkzeuge entwickelt. Als proof-of-concept dienen Vaccinekandidaten gegen Malignes Melanom und Lungenkrebs. Das Teilprojekt wird eine für die Systemmedizinische Anwendung in der Krebsimmuntherapie optimierte Konfiguration des Wissensmanagementsystems BioXM generieren. Dazu wird ein semantisches Wissensmodell für die im Rahmen des Immunmonitoring anfallenden Datentypen und Informationen entwickelt (z.B. klinische Daten, Biopropen Metadaten, Immunsequenzierungsdaten, Analyseergebnisse). Für die Datenintegration werden Harmonisierungsprozesse und automatische Datenvalidierungsmethoden optimiert bzw. implementiert. Bestehende primäre Datensammelsysteme werden über standardisierte Schnittstellen eingebunden.