Verbundprojekt: Wissensbasierte, personalisierte Krebstherapie (Triple-T); Teilprojekt: Hochdurchsatz-Seqenzierung der Transkriptome und Methylome Laser-mikrodissektierter Tumor-Subgewebe zur Verbesserung der Behandlung von Therapie-resistentem Lungenkrebs im Rahmen der personalisierten Medizin

Lungenkrebs ist auch heute noch weltweit eine der tödlichsten Krebsarten. Die meisten Patienten entwickeln nach der Erstbehandlung Rezidive und sterben daran. Ziel des Triple-T-Projekts ist die Entwicklung eines innovativen Verfahrens zur Identifikation therapierelevanter genetischer Profile der verschiedenen neoplastischen und nicht-neoplastischen Zelltypen in Lungenkrebstumoren und deren bioinformatische Verknüpfung mit Kinom-Daten. Daraus wird eine Therapieempfehlung zur individuellen Behandlung von Lungenkrebspatienten erstellt, deren Krebs sich zunächst als behandlungsresistent erwiesen hat. Das Projektziel der GenXPro ist die Entwicklung und Anwendung von molekularbiologischen und bioinformatischen Methoden zur Sequenz-basierten Transkriptom- und Genomprofilierung kleinster Tumorproben, die an der Universitätsklinik Groningen durch Laser-Mikrodissektion gewonnen werden. Die aus den Sequenzprofilen ermittelten Eigenschaften der Tumorkomponenten werden bioinformatisch mit den Kinom-Daten abgeglichen, die von der Partner-Firma PamGene gewonnen werden. Grundlage der Arbeiten bilden Lungenkrebstumore von Patienten, die bereits Rezidive entwickelt haben. Die einzelnen Zelltypen individueller Tumore werden vom Projektpartner Universität Groningen unter dem Mikroskop mit Hilfe eines Lasers aus dem Tumorgewebe ausgeschnitten. Die GenXPro wird dann durch modernste Hochdurchsatz-Sequenzierung die genetischen Profile von 100 bis 1000 Zellen jedes Zelltyps ermitteln. Diese werden zusammen mit den Daten über die Kinase-Aktivität der Gewebe bioinformatisch ausgewertet. Dadurch werden die von individuellen Tumoren genutzten Stoffwechsel- und Signalprozesse bestimmt, die gezielt individuell therapeutisch beeinflusst werden können. Aus diesen Daten wird für den behandelnden Arzt eine Dokumentation erstellt, welche als Grundlagen für seine Therapie-Entscheidung dienen kann