Infect-ERA II Call: CampyRNA - Untersuchung von regulatorischen RNAs in den frühen Phasen von Campylobacter Infektionen (Teilprojekt Eulalio)

Bakterielle Infektionen sind durch eine Interaktion zwischen Pathogen- und Wirtsantwort bestimmt. Zunehmend werden nicht-kodierende RNAs (ncRNAs) als wichtige post-transkriptionale Regulatoren der Genexpression in Infektionen wahrgenommen: Auf der bakteriellen Seite beinhaltet dies kleine regulatorische RNAs (sRNAs), die zur Kontrolle von Genen der Stressantwort oder Virulenz als Antisense-RNAs agieren oder , direkt auf die Proteinaktivität einwirken. Auf der Seite des Wirtes sind es MikroRNAs (miRNAs), welche post-transkriptional die Expression von zellulären mRNAs unterdrücken und welche eine entscheidende Rolle bei der Kontrolle von Immunantwort-Signalwegen im Verlauf bakterieller Infektionen spielen. In unserem Juniorkonsortium werden wir Campylobacter jejuni (C. jejuni), die zur Zeit häufigste Ursache bakterieller Lebensmittelvergiftungen, als Modelorganismus nutzen, um die Rolle von ncRNAs von Pathogen und Wirt in den Anfangsphasen der Infektion zu untersuchen. Um ein besseres Verständnis von ncRNAs zu erhalten, welche die ersten Phasen der C. jejuni Infektion regulieren, einschließlich Adhäsion an und Invasion von Epithelzellen, werden wir Hochdurchsatzmethoden und Einzelzell-Mikroskopiertechniken verwenden. Als Partner in diesem Konsortium, wird sich mein Labor auf die Identifizierung und funktionale Charakterisierung der Wirtszell-miRNAs konzentrieren, welche die Anfangsphasen der C.jejuni Infektion regulieren und auf deren Zielgene und Zielsignalwege. Innerhalb des CampyRNA-Konsortiums wird sich mein Labor auf folgende Aufgaben konzentrieren: 1. Identifikation von Wirtszell-miRNAs, die durch eine C.jejuni Infektion unterschiedlich reguliert werden 2. Identifizierung von Wirtszell-miRNAs, welche die Anfangsphasen der C. jejuni Infektion regulieren 3. Funktionelle Charakterisierung ausgewählter Wirtszell-miRNAs 4. Einzellzell-Charakterisierung der Rolle von ausgewählten Wirt miRNAs in C. jejuni Infektionen.