DISRUPT: Bekämpfung von antimikrobiellen Resistenzen durch Hochdurchsatz-Analyse von Biofilm-auflösenden Agenzien und Mechanismen

Bei vielen bakteriellen Infektionen kommt es zur Bildung von Biofilmen, welche oft Resistenzen zeigen und nur sehr schwer mit derzeitigen Antibiotika therapiert werden können. Dazu gehören Wundinfektionen (z.B. durch Pseudomonas aeruginosa oder Staphylococcus aureus verursacht), Harnwegsinfektionen (z.B. Escherichia coli), chronische Atemwegsinfektionen (z.B. P. aeruginosa) und Kolonisierung durch Streptococcus pneumoniae. Neue Strategien und Medikamente zur Bekämpfung solcher Infektionen werden dringend benötigt, allerdings sind die in der Bildung von Biofilmen involvierten Gene und Mechanismen nur sehr unvollständig aufgeklärt. Im vorliegenden Projekt werden wir Werkzeuge entwickeln, um sowohl Zielmoleküle als auch Reagenzien zu identifizieren, welche die Auflösung von Biofilmen von P. aeruginosa, E. coli, S. aureus und S. pneumoniae ermöglichen. Dies soll durch neuartige genomische Methoden wie Transposon-Sequenzierung und CRISPR-Interferenz, automatisierte Plattformen zur Messung von Biofilmen, sowie Hochdurchsatz-Screening von Antikörpern und Wirkstoff-Kandidaten erreicht werden. Anschließend werden wir die zu Grunde liegenden molekularen Mechanismen zur Inhibition von Biofilmen untersuchen. Die resultierenden Ergebnisse sind sowohl für die Grundlagenforschung als auch zur Entwicklung neuer therapeutischer Ansätze gegen bakterielle Infektionen von höchster Bedeutung.