Infect-ERA IV Call - MOSQUIVIR - Quantitative Transkriptions- und Translationsanalyse zur Identifizierung von Schlüsselfaktoren der Infektion durch sich neu verbreitende Viren und deren Anpassung an Wirbeltier- und Insektenwirte

Im Zentrum des Antrages steht das Chikungunya virus (CHIKV) als Beispiel eines "Emergenten Virus", dessen Lebenszyklus zwischen Moskitos und Wirbeltierwirten wechselt. Durch eine systembiologische Analyse viraler Transkription und Translation werden wir die entscheidenden Schritte der Infektion rekapitulieren und verstehen, wie das Virus sein Genom in sehr unterschiedlichen Organismen replizieren und translatieren kann. Zunächst wird der Ablauf der viralen Infektion in menschlichen Zellen und Moskitozellen in Zellkultur modelliert und mittels RNAseq und Ribosomen Profiling analysiert. Parallel dazu wird ein Protokoll entwickelt, dass es erlauben wird, aus geringsten Mengen an RNA Ribosomen Profiling Bibliotheken herzustellen. Als zweiter Schritt erfolgt die Analyse von Translation und Transkription während einer Infektion im Mausmodell und Moskitos. Sowohl die Daten aus Zellkultur als auch aus den in vivo Modellen werden einer umfassenden Systemanalyse unterzogen, um kritische Faktoren für eine erfolgreiche Infektion zu identifizieren und in vivo zu testen. Diese Ergebnisse werden für die Identifizierung von kleinen Molekülen, die antivirale Eigenschaften besitzen, verwendet.