ERA CoBlueBio Call1: SNAP - Enzymbasierte Extraktion und Aufwertung von Fukoidan und Alginat

Das Teilprojekt konzentriert sich auf die Extraktion und enzymatische Analyse des Polysaccharids Fukoidan und Alginat aus Braunalgen. Zellwände von Braunalgen sind eine komplizierte Matrix aus Alginat und Fukoidan sowie weiteren Polysacchariden und phenolischen Substanzen. Diese Matrix erschwert die Extraktion von Fukoidan, welches in Folge oft mit Laminarin, Alginat und anderen Substanzen kontaminiert ist. Durch die enzymatische Verdauung des Haupt-Matrix Polysaccharids Alginat soll hier die Extrahierbarkeit von Fukoidan erleichtert werden. Aus diesem Grund wird ein enzymatischer Ansatz entwickelt, um das Alginat in den Zellwänden von Braunalgen zu verdauen und somit die Extrahierbarkeit von Fukoidan zu verbessern. Zudem wird dieser Enzym-Ansatz verwendet, um die Menge des Alginats und des Fukoidans zu quantifizieren und somit Aussagen über die Qualität der Alge als Quelle dieser Polysaccharide treffen zu können. Zusätzlich werden diese Alginat Lyasen mit anderen Enzymen kombiniert (Laminarinasen, Proteasen), um die Qualität des extrahierten Fukoidans zu erhöhen. Um die strukturelle Analyse von Fukoidan zu erleichtern, werden zudem putative Fukoidanasen aus dem marinen Verrucomikrobium Lentimonas spp. kloniert und biochemisch charakterisiert. Diese Enzyme werden verwendet, um Fukoidan in Oligosaccharide zu hydrolysieren. Diese Oligosaccharide werden dann mittels NMR und Massenspektrometrie strukturell charakterisiert. Die Oligosaccharide aus Alginat, Laminarin und Fukoidan werden den Partnern für Bio-Assays zur Verfügung gestellt.