FACCE-ERA-NET+: GENOMITE - Entwicklung einer neuen Generation von dauerhaften Methoden zur Kontrolle von Spinnmilben, die aufgrund des Klimawechsels in Europa neue Pflanzenspezies besiedeln

Vorhabenziel : Ziel Gesamt : Klimaveränderungen werden weltweit zu Veränderungen bei den Pathogenen, die Nutzpflanzen befallen, führen. Ziel des Projektes ist die umfassende Beschreibung und Modellierung der Auswirkungen des Klimawandels auf den Befall von Nutzpflanzen ( Tomate, Erdbeere) durch Spinnmilben. Ziel spezifisch ( metasysx) :Ziele dieses Teilantrages ist die umfassende Analyse des Metaboloms und Lipidoms von Erdbeere und Tomate in Abhängigkeit vom Befall durch unterschiedliche Spinnmilben, (Generalisten, Spezialisten) sowie bei unterschiedlichen Umweltbedingungen und die integrative Analyse dieser Daten mit Transkriptomdaten. Weitere Ziele sind die umfassende Charakterisierung des Metaboloms/Lipidoms verschiedener Spinnmilben sowie der Erdbeere und Tomate (metabolic inventory) sowie die Identifizierung Resistenz vermittelnder Metabolite und Lipide. Gesamt : Tolerante und suszeptible Erdbeer- und Tomatenpflanzen werden bei verschiedenen Umweltbedingungen mit verschiedenen Spinnmilben infiziert und zu verschiedenen Zeitpunkten nach der Infektion Proben von Pflanzen sowie von Spinnmilben genommen. Diese Proben werden dann genomisch, transkriptomisch und metabolomisch analysiert und diese Daten mit Metadaten zur Modellierung des Einflusses des Klimawechsels auf Spinnmilbenbefall verwendet. Spezifisch : Erfassung und Analyse der Lipidom- und Metabolomdaten einschliesslich der Erstellung eines Inventory; Integration mit Transkriptomdaten.