Verbundprojekt: Erschließung neuer bakterieller Produzenten in artenreichen Habitaten Indonesiens - ANoBIn -; Teilvorhaben: Isolierung, Charakterisierung und Hinterlegung neuartiger mikrobieller Wirkstoffproduzenten

Vorhabenziel Ziel des Vorhabens ist die Gewinnung von bisher unbekannten Bakterien und Hefen mit der Fähigkeit zur Synthese neuer Antiinfektiva aus indonesischen Habitaten. Dazu soll eine Forschungspipeline für die Detektion und Isolierung der Mikroorganismen sowie die nachfolgende Wirkstoffsuche etabliert werden. Das Teilprojekt der DSMZ fokussiert dabei auf neuartige Vertreter der Acidobacteria, Alphaproteobacteria, Chloroflexi und Gemmatimonadetes, die aus geeigneten natürlichen Proben gewonnen, charakterisiert und als Lebendkultur konserviert werden. Auf der deutschen Seite ist das Teilprojekt zudem verantwortlich für die Entwicklung und Etablierung einer gesetzeskonformen Umsetzungsstrategie für das Gesamtvorhaben und bietet den indonesischen Partnern Trainingsmöglichkeiten für den gezielten Wissenstransfer von Kultur- und Sequenzierungstechnologien. Arbeitsplanung Die Arbeiten werden auf bisher kaum untersuchte Bakteriengruppen fokussiert, für die eine potentielle Wirkstoffsynthese bekannt oder wahrscheinlich ist. Als Ausgangsmaterial werden entsprechend mikrobielle Gemeinschaften aus giftigen bzw. ungenießbaren Pflanzen und Tieren, Biofilmen sowie Böden und Gewässern verwendet. Zunächst werden Vertreter der Acidobacteria, Alphaproteobacteria, Chloroflexi und Gemmatimonadetes mit kulturunabhängigen Sequenzierungsverfahren in dem Probenmaterial detektiert und mit metagenomischen Ansätzen erste Hinweise auf das biosynthetische Potential der Zielorganismen gesammelt. Mit innovativen Hochdurchsatzkultivierungsmethoden werden geeignete Bakterienarten anschließend isoliert, und die isolierten Bakterienstämme mittels Hemmtests und Genomsequenzierung charakterisiert. Alle Bakterienstämme werden in Sammlungen hinterlegt und die gewonnenen Daten in gemeinsamen Datenbanken dokumentiert. Über einen bilateralen Workshop und nachfolgende Beratungen mit den indonesischen Partnern werden Regelungen und Verfahrensweisen für die nachfolgende Verwertung der Isolate etabliert.