Infect-ERA III Call - Verbundprojekt: SalHostTrop - Verständnis des human-spezifischen Wirtstropismus typhoidaler Salmonellen - TP A

Dieses Projekt stellt einen umfassenden und innovativen Ansatz für das Verständnis des Wirtstropismus von klinisch relevanten Infektionserregern dar. Durch Verwendung von ergebnisoffenen Screening-Ansätzen und komplementären Analysen wird dieses Konsortium die erste eingehende gleichzeitige Analyse für die Genexpression von Wirt und Erreger während einer Infektion generieren. Die Wirtsspezifität von Salmonellen ist immer noch eine ‚black box‘, jedoch von grundlegender Bedeutung für das mechanistische Verständnis der verschiedenen Krankheiten, die von typhoidalen (TS) und nicht-typhoidalen (NTS)Salmonella enterica Serovaren verursacht werden. Die resultierenden Daten werden wesentlich dazu beitragen, sowohl die Identifizierung von bakterielle Virulenzfaktoren und Wirtsfaktoren voran zu treiben, die die Wirtsspezifität und Mensch-Salmonella-Wechselwirkungen definieren. Solche Daten können zur Identifizierung neuer Ziele zur Bekämpfung von Infektionen durch diese Erreger führen. Unser Arbeitsplan vereint etablierte Forscher aus führenden Universitäten und Forschungsinstituten. Damit steht ein breites Spektrum an know-how im Bereich der klinischen Bedeutung von TS und NTS, von state-of-the-Art-Genomik und Bioinformatik, Genetik und Molekularbiologie von Salmonellen, Mikrobiologie und Biologie der Wirtszelle zu Verfügung. Diese interdisziplinäre Expertise wird synergistisch eingesetzt, um die weitreichenden Ziele zu erfüllen. Es ist vorgesehen, vergleichende Doppel-RNA-Sequenzierung (dRNA-seq) durchzuführen, um die Wirt-Pathogen-Wechselwirkungen der klinisch hoch relevanten human–adaptierten S. Typhi und S. Paratyphi A Serovare im Vergleich zu S. Typhimurium und S. Enteritidis zu charakterisieren. Andere unabhängige Ansätze werden auch genutzt, um NTS- oder TS-spezifische Faktoren der Wirts-Spezifität zu identifizieren. Das Arbeitsprogramm ist in neun eng vernetzte Arbeitspakete (WP) aufgeteilt.