Verbundprojekt: Entwicklung eines inVitro Diagnostik Workflows zur qualitativen und quantitativen Identifizierung multipler Erreger bei immunsupprimierten Patienten; Teilprojekt: Neuentwicklung und Optimierung von funktionalisierten Oligonukleotiden zur invitro Diagnostik auf Basis der SmartFinderTechnologie

Die Ella Biotech GmbH ist Partner eines Konsortiums, das für immunsupprimierte Patienten (z.B. in der Krebstherapie oder bei Transplantationen) einen PCR basierten Test (Assay) zur schnellen Identifizierung verschiedenster pathogener Keime entwickelt. Die dabei eingesetzte molekularbiologische PCR Methode zur qualitativen und quantitativen Identifizierung möglichst vieler (bis zu 20) multipler Erreger, benötigt als Ausgangsstoffe kurze definierte und funktionalisierte DNA-Sequenzen (sog. Oligonukleotide). Diese können mit Hilfe einer chemischen Synthese an fester Phase dargestellt werden. Für den geplanten Assay sollen Primer, FRET-Akzeptoren und -Donoren, sowie sogenannte Sonden (hydrolysis probes) mit speziellen Eigenschaften neu entwickelt werden. Die Entwicklung dieser Produkte und auch deren Optimierung soll in einem sehr intensiven Austausch bis zum endgültigen Funktionieren des Assays zwischen Oligonukleotid Produzenten (der Ella Biotech GmbH), dem Diagnostik-Assay Entwickler (PathoFinder) und dem Geräte- und Softwarehersteller (IT-IS) geschehen. Die klinische Erprobung erfolgt abschließend an der Charité in Berlin. Die Ella Biotech GmbH entwickelt, optimiert und produziert in ihrem Teilprojekt mittels organischer Synthese an fester Phase hoch funktionalisierte Oligonukleotide. In einer engen Kooperation mit dem Partner Pathofinder ist es hierbei die Aufgabe der Ella Biotech GmbH, die Oligonukleotide zu entwickeln, und zuvor die synthetische Machbarkeit dieser Oligonukleotide zu evaluieren. Die neu designten und synthetisierten Oligonukleotide werden beim Partner PathoFinder unter den Bedingungen des Assays getestet und etwaige Verbesserungen bzw. Änderungen in enger Absprache mit der Ella Biotech GmbH erneut umgesetzt.