Hauptaufgabe des Projektträgers PTJ ist die fachliche und administrative Betreuung von Projekten, die im Rahmen von Forschungs- und Technologieprogrammen des BMBF, des BMWA und des BMU gefördert werden. Dazu gehören:
- wissenschaftlich-technische Beratung der Antragsteller und Unterstützung bei der Vorbereitung von Projekten, sowie Erstellung der Empfehlung für die Förderentscheidung des zuständigen Bundesministeriums (Antragsphase)
- wissenschaftlich-technische und administrative Betreuung der Projekte und Mittelverwaltung während der Vorhabensdurchführung (Projektphase)
- Mitwirkung bei der Ergebnisbewertung der Projekte und Förderprogramme und Unterstützung der Bundesregierung bei der Planung, Analyse und Weiterentwicklung von Programmen
- im Rahmen der beliehenen Programme/Förderaktivitäten trifft PTJ die abschließende Förderentscheidung.
Darüber hinaus ist der Projektträger PTJ als Nationale Kontaktstelle für die EU mit der Wahrnehmung von Aufgaben für verschiedene Forschungsprogramme der Europäischen Union beauftragt.