Das Ministerium für Wissenschaft, Innovation und Hochschulen (Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades) ist zuständig für die Umsetzung der Regierungspolitik im Bereich der wissenschaftlichen und technischen Forschung, der technologischen Entwicklung und der Innovation in allen Bereichen zuständig, einschließlich der internationalen Beziehungen in diesem Bereich und der Vertretung Spaniens in Programmen, Foren und Organisationen der Europäischen Union und internationaler Organisationen, die in seinen Zuständigkeitsbereich fallen.
Nachdem das 2020 als eigenes Ressort entstandene Ministerium für Universitäten im November 2023 wieder eingegliedert wurde, umfassen die Kompetenzen des Ministeriums wieder den Hochschulbereich.