Ziel des Gesamtprojekts ist es, Lymphom- Subpopulationen und ihre zelluläre Mikroumgebung gründlich zu charakterisieren und deren Einfluss auf das Ansprechen auf Chemoimmuntherapie zu verstehen. Dazu werden am Universitätsklinikum Heidelberg lebensfähig eingefrorene Zellen aus Lymphknotenbiopsien auf mehreren biologischen Ebenen untersucht. Als Ausgangspunkt werden wir Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes by Sequencing (CITE-Seq) verwenden, das gleichzeitig das Transkriptom und das Oberflächenproteom einzelner Zellen charakterisiert und so mögliche Subpopulationen mit hoher Auflösung aufdeckt. Darauf aufbauend werden wir Genomsequenzierung, Tiefenproteomik und ex-vivo-Profilierung der Medikamentenempfindlichkeit untersuchen. Wir werden diese Multi-omics-Daten nutzen, um die minimale Anzahl von Merkmalen zu bestimmen, die zur Charakterisierung der Subpopulationen erforderlich sind. Diese Marker werden wir verwenden, um in Formalin-fixiertem, Paraffin-eingebettetem (FFPE) Gewebe mittels Multiplex-Immunfluoreszenz Subpopulationen nachzuweisen. Diese Untersuchung an diagnostischen Proben erlaubt eine Korrelation mit dem Therapieansprechen. Zusammen mit den weiteren Untersuchungen unserer Projektpartner werden wir versuchen aufzuzeigen, wie die begrenzte Anwendbarkeit modernster Einzelzelltechniken in diagnostischen Biopsien überwunden werden kann. Damit werden wir die Entwicklung von Instrumenten zur Patientenstratifizierung fördern, die von ethisch validierten Leitlinien für die Kommunikation mit Krebspatienten begleitet werden. Das Vorhaben ist Teil des transnationalen Verbundprojekts "SYMMETRY" der Förderinitiative "ERA-PerMed". Der Verbund "SYMMETRY" wird durch Prof. Sascha Dietrich, Universitätsklinikum Heidelberg, koordiniert und hat insgesamt 7 Projektpartner.
SYMMETRY – Tumor Subpopulationen und Mikromilieuaktivität zur Vorhersage des Therapieansprechens in Lymphomen
Laufzeit:
01.05.2022
- 30.04.2025
Förderkennzeichen: 01KU2210
Koordinator: Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf - Universitätsklinikum Düsseldorf - Klinik für Hämatologie, Onkologie und klinische Immunologie
Verbund:
ERA PerMed
Quelle:
Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF)
Redaktion:
DLR Projektträger
Länder / Organisationen:
Ungarn
Italien
Lettland
Norwegen
Schweden
Themen:
Förderung
Lebenswissenschaften
Weitere Informationen
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- PerSAIDs – Personalisierte Medizin für Autoinflammatorische Erkrankungen
